Piše se i jedno i drugo.
Imenica čistoća upotrebljava se u materijalnom smislu, odnosno u doslovnom značenju: čistoća kose, kuće, legure, odeće i sl.
Imenica čistota upotrebljava se u duhovnom smislu, odnosno u figurativnom značenju: čistota duše, jezika, misli, osećanja i sl.